Детское отделение нейроинфекции рассчитано на 30 ребятишек, а за год в нём пролечиваются около 1300 больных. Отделение работает как неотложное и принимает пациентов со всего города. Помещение отделения оборудовано одно- и двухместные боксами, где размещаются больные с такими инфекциями, как бактериальные и вирусные менингиты различной этиологии, менингоэнцефалиты, инфекции, передающиеся иксодовыми клещами.